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En este período la casa quedó suficientemente terminada para la Comunidad, gracias a la diligencia y habilidad del P. Superior Felipe Lérida y a las limosnas recibidas de Argentina y Uruguay.
Como hecho importante de este período puede señalarse la visita del Corazón del Beato Roque González.
El último acto con que terminó su superiorato fue la escrituración a favor de la Compañía de un terreno que había de ser valioso, regalado por el Sr. Gualberto Cardús Huerta, en la esquina de Colón y Carlos Antonio López.
El 23 de enero de 1938 por un decreto del P. Provincial es nombrado Superior de la Casa el P. José Pedrosa, en reemplazo del P. Vicente Alvado, quien tenía grandes dotes misioneras pero pocas para Superior, por eso con agrado entregó el bastón de mando.
En principio, se tenía en Cristo Rey los jóvenes y niños aspirantes al grado de Hno. Coadjutor. A éstos se les daban clases de religión, se les enseñaba a leer, escribir, aritmética, dibujo y algunas otras materias para proporcionarles una indispensable cultura, mientras se les iniciaba en algún oficio y en servicios domésticos.
Con el P. José Pedrosa de Superior, educador de profesión y compenetrado con la mente de "San Ignacio" sobre el valor que tiene la educación en Colegios, para la formación y conducción de los pueblos, su primer acto fue abrir aulas para la enseñanza primaria graduada, haciendo que los niños de la Escuela Apostólica cursaran estudios en ese Colegio con el nombre de "Cristo Rey".
El mes de febrero de 1938 se pasó en acomodar la casa primitiva; se abrió la inscripción el 21 de febrero del mismo año, y el 14 del siguiente mes se realizó el acto de apertura del curso escolar con una Misa del Espíritu Santo.
Asistieron todos los profesores y alumnos; habló el P. Director y luego se desarrolló una breve clases, casi de presentación en sus respectivas aulas.
En el primer año funcionaron sólo los tres primeros grados, en los cuales se refundieron los alumnos de la Escuela Apostólica y 75 niños externos. El Programa de Estudios era el oficial, incluyendo el de Religión, como materia principal y fundamental.
Los tres primeros años fueron muy difíciles para la prosperidad de la Escuela, sin embargo, el alumnado había aumentado, pero no llenaba las aspiraciones pedagógicas de sus fundadores, hasta que en el cuarto año (1942) el Superior, considerando las cualidades pedagógicas del Hno. Rodríguez, lo nombró Vice Director para que actuara con plena autoridad. Comenzó éste por hacer una prudente selección, ordenó las cosas y estableció pautas educativas para el cambio. Empezó la Escuela a mejorar hasta alcanzar en pocos años un crédito y estimación que ya no perdió, sino que fue creciendo día a día.
El número de alumnos oscilaba entre 350 y 450 y participaban de actos públicos sobre materias estudiadas, actuaciones teatrales y desfiles colegiales.
El 6 de noviembre de 1951 es nombrado Superior de la Casa de Cristo Rey el P. Antonio Abad, quien acababa de llegar de España juntamente con los PP. Arcusa, Vidal, Palacios y Tormo.
Como la población escolar había aumentado mucho en el Paraguay, se pensó abrir el Colegio Secundario, encargándose al PP. Rector Antonio Abad iniciara los cursos secundarios, lo cual lo hizo en marzo de 1952.
Se comenzó con el Primer Curso del Bachillerato, aumentando uno en cada año hasta completar los Seis Cursos. En los primeros años se tuvieron también clases de Comercio.
El Programa de Estudios era el mismo del Estado, con la enseñanza religiosa. El fundador y Primer Rector fue el P. Abad con el P. Antonio Rojas de Prefecto.
El profesorado, aunque con frecuencia era jesuita, no obstante se hubo de integrar con laicos. Se rigió conforme a las normas generales del Colegio.
Por entonces ya surgió la idea de un Colegio nuevo, se hizo el anteproyecto, pero surgieron problemas de financiación.
El año 1952, se caracterizó además, con la apertura de las clases de Radio Técnica (22 de marzo), cuyo fundador fue el P. Francisco Ayala, ampliando así la compañía la esfera de su acción cultural.
También se iniciaron cursos de formación catequística para jóvenes de ambos sexos. Su finalidad era impartir una cultura religiosa superior y además obtener profesores de Religión para el caso que se enseñara Religión en las Escuelas del Estado.
Los primeros años, por razón del frecuente cambio de Prefectos, el Colegio no pudo adquirir una característica muy definida, aunque año tras año conquistara una fama indiscutible de buen Colegio.
De 1952 a 1961 se sucedieron los siguientes Directores:
* P. Antonio Rojas (1952)
* P. Teófilo Osuna (1953)
* P. José Comas (1954)
* P. Mario Ferré (1955)
* P. Vicente Palacios (1956)
* P. Teófilo Osuna (1957-1958)
* P. Claudio Avilés (1959-1960)
* P. Manuel Pérez Sesé (1961)
En agosto de 1953, apareció la 1a. revista del Colegio Cristo Rey, con el nombre de "La Voz del Colegio" en forma mimeografiada.